英特尔,联想和华大今天宣布,这三家公司正在合作加快新冠肺炎新型冠状病毒的基因组特征分析。英特尔和联想的专业技术和生命科学专家将共同努力,为华大基因研究人员提供新的大数据分析技术和计算资源,进一步增强其基因测序工具的分析能力,更高效地研究新型冠状病毒的基因组特征。
英特尔和联想为华大基因提供的技术包括一个大型高性能计算集群,可用于处理从华大DNB SEQ-T7测序系统读取的高通量数据。华大基因的研究人员将能够通过新的高性能计算和基因组分析技术,以及来自英特尔和联想的相关资源和专业知识,进一步加快对新型冠状病毒基因组特征的研究。这项技术将支持科学家研究病毒模式的毒性和传播,以及病原体和宿主之间的相互作用,从而为流行病学和疫苗设计研究做出贡献。这些努力对于创造更好的诊断方法和设计有效的疫苗或其他保护措施(如免疫疗法)是必要的。
通过这次合作,华大基因将继续优化其新型冠状病毒检测试剂盒,并获得大量有价值的信息。这些信息将有助于确定未来开发有效疫苗或治疗的潜在目标方法。通过英特尔和联想,联想的共同努力,超级计算技术支持和优化了“基因组优化和可扩展性工具”(简称GOAST),该工具首先由英特尔?基因组分析工具获得(经选定解决方案验证),可将全基因组测序和全外显子测序的计算速度加快40倍,帮助华大优化计算过程,高效处理数据,更快地生成可靠的基因组分析结果,从而缩短科研和临床观察的时间。
“目前,我们对这种新型冠状病毒还有很多不了解的地方。通过分析病毒基因组数据,华大基因加速了对感染者的快速识别和基因组特征的研究,而这些任务需要巨大的计算资源,而这正是我们可以发挥作用的地方。”英特尔营销集团副总裁兼中国区总经理王锐,表示:“因此,我们紧密合作,为在防疫第一线进行病毒研究的科学家提供更多的计算资源和专业支持,希望与狡猾的病毒赛跑,帮助防控疫情。拯救更多生命。”
联想集团高级副总裁、企业技术集团总裁童夫尧,表示:“新型冠状病毒疫情影响全国人民的心灵。作为世界领先的高性能计算制造商,联想一直致力于为生命科学研究提供计算能力支持。来自英特尔和联想的大数据分析以及健康和生命科学专家将整合我们的资源和专业知识,帮助解决当前面临的严峻挑战,并促进健康和生命科学的发展。”
在基因测序中,每毫升体液通常含有数百万个不同的病毒体,每个病毒体的基因组含有约3万个DNA碱基或字母。华大基因正在对许多感染患者和疑似感染患者的微生物进行测序,因此这些研究将产生大量的结核病水平甚至结核病水平的数据。为了高效快速地处理这些重要数据,需要采用更先进的HPC基础设施、计算技术和优化的基因组分析方法。
总部设在深圳,的华大基因公司是专注于生命科学和基因研究的世界领先公司之一。基因首席信息官金表示:“基因已经对数百份临床样本进行了测序,以分析和区分感染的并发症。生物信息学领域的技术,如基因组比对、基因组组装、基因组注释和病毒核酸片段的系统分析,是一个高密度的计算过程,因此充足的高性能计算对于提高分析效率非常重要。能够使用最新的高性能计算和基因组分析技术是提高分析效率的重要因素。该设备和技术将加快新型冠状病毒感染者的快速鉴定和病毒基因组特征的研究,为新型冠状病毒精准的诊断、治疗和疫情防控提供有力支持。”